蓝莓苗灰霉病主要发生于定植初期的扣小拱棚期间。由于低温、寡照、湿度大，该病易发生，并危害严重。症状为植株各部位有灰色霉状物，严重者整株死亡。喷药防治，异菌脲类药物效果较佳， 如扑菌灵1000倍、倍保1200～1500倍、扑海因1000—1500倍，7—10 d喷1次，连续二三次。
蓝莓苗根(茎)腐病发生于定植初期，危害根或近基质茎部，严重的引起死亡。防治上首先将基质消毒，控制基质湿度，使之相对稳定；及时喷施恶霉灵3000—4000倍液、多效灵1500倍液等。蓝莓苗 枝条枯萎病主要发生于中前期，新梢(枝)顶端坏死，沿茎向下侵染，至整株枯死。可定期喷保护药剂如甲托1500倍液、倍保1000～1500倍液、多菌灵1500倍液等。蓝莓苗蚜虫主要危害新梢，易传播病毒 病，一旦发生须及时防治，如喷吡虫啉1500-2000倍液，蚜虱净2000倍液，阿维菌素2000～3000倍液等。